Новый вид анаэробной сульфатвосстанавливающей бактерии из газогидратоносных донных отложений северной части Японского моря
Ученые из ТОИ ДВО РАН совместно с коллегами из Института биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина РАН, г. Пущино, обособленного подразделения ФГБУН «Федеральный исследовательский центр «Пущинский научный центр биологических исследований РАН», выделили и описали новый вид анаэробной сульфатвосстанавливающей бактерии (СВБ) из газогидратоносных донных отложений северной части Японского моря, обладающей уникальными свойствами – высокой способностью к нефтедеструкции.
Еськова А.И., к.б.н. лаборатории комплексных исследований окружающей среды и минеральных ресурсов ТОИ ДВО РАН под руководством к.б.н., с.н.с. Пономаревой А.Л. и коллег из лаборатории анаэробных микроорганизмов ИБФМ РАН впервые выделила представителя рода Desulfosporosinus из дальневосточных морей и показала ее способность к анаэробной деградации углеводородов нефти. Данное свойство среди сульфатвосстанавливающих бактерий встречается крайне редко. До настоящего времени выделено и описано всего лишь 5 чистых культур СВБ, обладающих данной способностью, но имеющим гораздо меньшую эффективность нефтедеструкции по сравнению с новым видом, и не одна из них не относится к роду Desulfosporosinus.
Новая бактерия Desulfosporosinus shakirovi названа в честь ученого – геолога, внесшего большой вклад в организацию и развитие геомикробиологических исследований в Дальневосточном регионе России, д.г.-м.н., доцента Шакирова Рената Белаловича – заведующего лабораторией газогеохимии ТОИ ДВО РАН. Образцы осадка, в которых была обнаружена новая бактерия, были им отобраны в ходе экспедиции ТОИ ДВО РАН в 54 рейсе НИС «Академик Опарин», 2017 г. Новый штамм депонирован во всероссийскую и международные коллекции и базы данных в установленном порядке. Статья об открытии ученых будет опубликована в журнале «Микробиология» (2025, Т. 94, № 3).
Группой геомикробиологии лаборатории комплексных исследований окружающей среды и минеральных ресурсов ТОИ ДВО РАН совместно с лабораторией газогеохимии ТОИ ДВО РАН создается представительная коллекция микроорганизмов из морей западной части Тихого океана, арктического шельфа и Южного океана, которая дает основания надеяться на новые открытия. В настоящее время эти исследования выполняются также в сотрудничестве с НИЦ «Курчатовский институт».
Секвенированная последовательность генома штамма SRJS8 депонирована в GenBank под номером NZ_JAJDOO010000000. Культура депонирована во Всероссийскую коллекцию микроорганизмов (ВКМ) под номером В-3540, а также в японскую коллекцию микроорганизмов (JCM) под номером: JCM 39189 Desulfosporosinus sp. GenBank: MT740695.2 Desulfosporosinus sp. strain SRJS8 16S ribosomal RNA gene, partial sequence / Eskova, A., Ryzhmanova,Y. and Shcherbakova,V., 2020
